През април 1996 г. е представен изцяло новият модел Škoda Octavia. Три години по-късно се появява Fabia, а през 2001 г. е представена нова луксозна лимузина в горния среден клас - Superb.
В Млада Болеслав се произвежда милионното превозно средство Škoda от основаването на съвместното предприятие с VW.
Представена е Octavia. Тази втора производствена серия на марката проправя пътя за успеха на компанията през следващите години.
За първи път Škoda произвежда повече от 400 000 автомобила годишно, които се изнасят в 70 страни.
Škoda влиза в категорията на автомобилния спорт World Rally Car (WRC).
На автомобилното изложение във Франкфурт е представена абсолютно новата Škoda Fabia, а година по-късно тя е допълнена от Fabia Combi.
Škoda основава в Млада Болеслав първия управляван от компанията университет в Чешката република - Škoda Auto University.
Škoda Octavia RS досега е най-бързият сериен автомобил на марката.
Под традиционното име Superb, компанията представя нов луксозен модел, който съответства на историческата производствена серия от по-високи класове от 1934 до 1949 г.
Fabia WRC има своята премиера на автомобилното изложение в Женева.